Parmi les missions fondamentales du musée national des beaux-arts, la muséologie occupe, depuis 1998, une place centrale; à l’origine l’édifice avait été conçu pour abriter une collection d’art européen historique ; à l’indépendance, de nouvelles orientations muséales ont apparues qui intégraient la création de nouvelles sections et de nouvelles missions, telles que la conservation des œuvres et la restauration. Au cours des deux dernières décennies en particulier, le musée a ainsi mis en place un programme muséologique visant à donner une place accrue et fonctionnelle aux concepts de conservation préventive, de muséographie et de réhabilitation des œuvres et de l’édifice: ces missions fondamentales ont pu être concrétisées grâce à l’octroi de budgets spécifiques, de la part des ministères de la culture et des finances.
Parmi les nombreuses concrétisées, figurent la réhabilitation de l’édifice, classé monument historique en 1998, la rénovation et le réaménagement des aires de stockages (réserves), la création de deux nouveaux laboratoires pour la restauration des œuvres peintes et des œuvres d’art graphique, qui ont permis notamment la mise en place d’un programme de restauration des chefs-d’œuvre tels que Monet, Morizot, Pissaro, Renoir, Van Goyen;
Parallèlement, il s’est avéré nécessaire de revoir le parcours muséal et sa présentation afin de créer de nouveaux inexistants jusqu’alors (salle des céramiques, espace Baya, salle Despiau, salles orientalistes, salle des primitifs, etc…) afin que le visiteur puisse découvrir les différentes facettes de la collection.
En dernier lieu, il est important de mentionner les différentes actions mises en œuvre pour développer la fonction pédagogique, avec notamment la création d’un nouvel étage entièrement consacré à l’animation en direction des enfants et des jeunes